Научно-исследовательский институт фольклора, литературы и журналистики был образован на базе НИИФЛИ (студенческого научно-исследовательского института фольклора и литературы) им. А.Ф. Назаревича.
В 1962 г. заслуженным деятелем науки Дагестана, членом союза писателей Дагестана и РСФСР А.Ф. Назаревичем на базе филологического факультета Даггосуниверситета был создан единственный в стране студенческий научно-исследовательский институт, которому позже было присвоено имя его создатреля. Институт существовал на общественных началах. В основу деятельности института входило собирание, обработка, изучение фольклора и литератур народов Дагестана. На производственной практике по фольклору, охватившей уже в 1961 году около 300 студентов, институт подготовил свою первую печатную работу - сборник "Детский фольклор Дагестана".
При институте функционировал Совет под руководством директора. Первыми членами Совета института были С. Хайбулаев, И. Омаров, А. Тагиров, Г. Казиев, А. Дациев, Р. Багомедов.
С каждым годом углублялась и расширялась деятельность института. К работе были привлечены девушки-горянки из женского педагогического института. Уже в 1964 г. общественные сотрудники института собрали около 5 тыс. песен, сказок, легенд, загадок.
В 1968 г. институтом под руководством А.Ф. Назаревича впервые была организована экспериментальная научно-этнографическая экспедиция в казачью станицу Старогладковскую.
В 1969 г. в такую экспедицию было направлено уже две группы студентов, а в 1970 г. - три. В этом же году НИИФЛИ начинает свою работу по сбору материала для первой в стране студенческой коллективной диссертации о судьбах женщины горянки Дагестана. В составы 17 экспедиций входят студенты филологического факультета, факультета иностранных языков и сотрудники Института языка и литературы Дагестанского филиала Академии наук СССР. Руководили экспедициями студенты М. Магадов, Ш. Мазанаев, А. Дациев, М. Мусаев и другие.
Самым памятным в истории НИИФЛИ стал 1977 г. Стенд маленького института из Дагестана демонстрировался на ВДНХ в Москве, итогом чего стала серебряная медаль ВДНХ, которой институт гордится и по сей день.
К двадцатилетнему юбилею в НИИФЛИ было собрано уже более миллиона записей песен, легенд, сказок, пословиц, описаний обычаев, обрядов. На этом материале написаны сотни курсовых и дипломных работ, защищены 12 кандидатских и 1 докторская диссертации. Совместно с Союзом писателей Дагестана институт организовал для начинающих писателей научно-творческий семинар "Дагестанский лицей". На первом семинаре лицея выступал Расул Гамзатов.
Многие бывшие члены семинара сами стали известными писателями и учеными: Г. Гашаров, А.-К. Абдулатипов, С. Мухтаров, Г. Мудунова, Ф. Исрапова, Т. Пашаева, К. Расулов, М. Гасанов, В. Кочетов, К. Исрапилова и др.
В связи с необходимостью активизировать научно-исследовательскую работу по фольклору, литературе и журналистике в современных условиях в феврале 2001 г. на базе студенческого НИИФЛИ был открыт Научно-исследовательский институт фольклора, литературы и журналистики Дагестанского государственного университета. Институт вошел в университетский комплекс Республики Дагестан и в систему Дагестанского научного центра Российской Академии образования. Сохраняя лучшие традиции студенческой научно-творческой организации, НИИ филологии участвует в разработке новых направлений исследований и целевых программ. Институт призван сконцентрировать научный потенциал и силы профессорско-преподавательского состава университета в исследовании проблем фольклора, литературоведения, двуязычного художественного творчества и журналистики. Руководит институтом доктор филологических наук, прфессор, член-корреспондент РАЕН, декан филологического факультета ДГУ Ш.А. Мазанаев.
При институте уже создан ученый совет, в который вошли видные ученые не только Даггосуниверситета, но и Дагестанского научного центра РАН и Дагпедуниверситета. Среди них известный востоковед, переводчик Корана Н.О. Османов, писатель М.-Р. Расулов, известный журналист М.Д. Бутаев, доктор филологических наук С.М. Хайбулаев и многие другие.
Среди сотрудников института молодые ученые, кандидаты наук Назаревич Д.А. и Магомедова А.М. К работе в институте привлечены начинающие исследователи, соискатели кафедр филологического факультета Базиева З. и Расулова М.
